בין שנת הלימודים תשס"ז לשנת הלימודים תשס"ח נשרו 20,085 בני נוער בכיתות ט'-י"ב ממערכת החינוך בישראל (מתוך נתונים המופיעים ב: "ילדים בישראל שנתון סטטיסטי "2008, בהוצאת המועצה הלאומית לשלום הילד ומכון חרוב. דצמבר 2008). בני נוער אלו מהווים 4.5% מסך התלמידים במערכת החינוך.
בני הנוער הנושרים נחשפים לחיי הרחוב ומאמצים לעצמם דפוסי התנהגות הרסניים, כגון שימוש בסמים, ואף בסחר בסמים. רבים מהם מעורבים בפעילויות עברייניות, ולחלקם נפתחים תיקים פליליים במשטרה. אצל הנערות המנותקות אנו עדים למקרים רבים של פגיעות על רקע מיני ומשברים נפשיים קשים בעקבותיהן, עד כדי נטיות אובדניות.
מניפה מציעה עבור בני הנוער אפשרות לקבל מענה הוליסטי, תמיכה, ליווי והשתלבות מחדש במערכת החינוך. בני הנוער המנותקים "נאספים" מהרחוב ומשתלבים במרכז מניפה. המרכז ממוקם בתוך מבנה בית ספר, על מנת לשמר את עקרון רציפות ההזדהות, והציפייה להמשך תפקוד נורמטיבי.
המרכז מעניק לנער/ה מעטפת הכוללת תמיכה לימודית, חינוכית וטיפולית:
לימודית - בני הנוער לומדים לקראת יעדים נורמטיביים, כגון בחינות הבגרות. הלימוד מתבצע בקבוצות קטנות ובליווי אישי של פרחי הוראה. תכנית הלמידה נקבעת על ידי צוות מניפה הבכיר בראשות המנחה הפדגוגית.
חינוכית - לכל מרכז יש רכז חינוכי במשרה מלאה המפעיל תכנית לפיתוח זהות וערכים. הרכז עוקב אחר התקדמות הקבוצה בכלל וכל תלמיד בפרט. הרכז מפעיל גם תכנית חברתית ותכנית כישורי חיים.
טיפולית - צוות מקצועי של מטפלים מעניקים טיפול קבוצתי ופרטני במתכונת שבועית במשך שנת הפעילות. בנוסף, התלמידים משתתפים בסדנאות שטח, בתחום בו עוסק הטיפול באותו זמן.